Exom-Diagnostik

Zur Ermittlung der genetischen Ursache bei seltenen Erkrankungen

Finden Sie die genetische Ursache der Erkrankung Ihrer Patientin oder Ihres Patienten. ExomeXtra® analysiert gezielt dort, wo es klinisch entscheidend ist – und vereint das Beste aus Exom-Sequenzierung (WES), Genom-Sequenzierung (WGS) und Array-CGH in einem einzigen Test. ExomeXtra® detektiert 20 % mehr krankheitsverursachende Varianten als die herkömmliche Exom-Diagnostik. Ein Auftrag. Ein Befund. Mehr Antworten.

Ist Ihre Patientin oder Ihr Patient in Deutschland versichert? Unsere Kolleginnen und Kollegen vom Zentrum für Humangenetik Tübingen beraten Sie gerne!

Unser ExomeXtra®-Diagnostik-Portfolio auf einen Blick

Keyvisual TrioExomeXtra

Trio ExomeXtra®

Höchste diagnostische Ausbeute – elterliche Daten ermöglichen eine neue analytische Dimension

Beitragsbild CNV-Analyse

Single ExomeXtra®

Volle diagnostische Stärke – auch ohne elterliche Proben

Keyvisual EcomeFocus

ExomeFocus®

Kosteneffizient und zielgerichtet – fokussiert auf hochrelevante Varianten

ACMG Genes

Das zusätzliche Analyse der ACMG-Gene ermöglicht den Nachweis relevanter pathogener Varianten außerhalb des Phänotyps in einer definierten Gruppe von Genen mit therapeutischer Relevanz.1 Bei allen ExomeXtra®-Analysen ist diese Option für die Indexpatientin bzw. den Indexpatienten kostenlos. Für ExomeFocus® ist das Screening der ACMG-Gene gegen einen Aufpreis erhältlich. Wenn Sie diese Option wählen, erstellen wir für jede Person einen separaten Befund, in dem wir die Ergebnisse innerhalb der ACMG-Gene angeben. Details zu den Genen und assoziierten Erkrankungen finden Sie hier.

Beispielbefund herunterladen (PDF)

HLA-Typisierung

Die HLA-Typisierung identifiziert Allele, die für Immunerkrankungen und Transplantationsverträglichkeit relevant sind – einschließlich HLA-B27 bei entzündlichen und Autoimmunerkrankungen. Die Befunde werden in einem separaten Bericht ausgegeben.

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Pharmakogenetik

Die pharmakogenetische Analyse ermittelt genetische Veränderungen, die die Wirksamkeit von Medikamenten – darunter Antidepressiva, Analgetika, Neuroleptika, Antikoagulanzien, Chemotherapeutika, Anästhetika, Betablocker und Statine. Im Rahmen dieses Services analysieren wir 21 Gene, die an der Verstoffwechselung von Arzneimitteln beteiligt sind. Sie erhalten direkt verwertbare Informationen zur Individualisierung der Therapie und zur Reduktion des Risikos unerwünschter Nebenwirkungen.

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VUS Reassessment-Service

Die Forschung in der Humangenetik schreitet schnell voran. Neue medizinische und wissenschaftliche Erkenntnisse können dazu beitragen Fälle zu klären, die zum Zeitpunkt der ersten Untersuchung nicht geklärt werden konnten.

CeGaT bietet eine kostenlose Neubewertung für alle ungelösten postnatalen, nicht-prädiktiven Keimbahnanalysen auf Basis von Exom- oder Genomsequenzierung an. Dieser Service kann zwischen 12 Monaten und 5 Jahren nach Erstellung des ursprünglichen Befunds beantragt werden.

Unser Reassessment-Service geht über die reine Neubewertung einzelner Varianten unklarer Signifikanz (VUS) hinaus.

Varianten werden auf Basis unserer kontinuierlich aktualisierten High-Impact-Variantenliste ausgewählt und priorisiert. Diese Liste basiert auf öffentlichen Datenbanken, internen Variantenreklassifizierungen und Machine-Learning-Methoden zur Vorhersage der Variantenwirkung. Potenziell relevante Ergebnisse werden anschließend von erfahrenen Spezialistinnen und Spezialisten medizinisch bewertet. Das Ergebnis der Prüfung wird Ihnen entweder als aktualisierter ärztlicher Bericht oder als Mitteilung über die unveränderte Gültigkeit des initialen Berichts mitgeteilt.

Erfahren Sie hier mehr!

Die Vorteile von ExomeXtra® auf einen Blick

Besser als Exom

Detektiert 20 % mehr krankheitsverursachende Varianten als herkömmliche WES

Smarter als Genom

Umfassendere Abdeckung dort, wo es klinisch relevant ist – Detektion von Variantenklassen, die mit herkömmlicher WGS nicht zuverlässig erfasst werden

CNV-Detektion mit Array-CGH-Auflösung

 Genomweite Erkennung von Deletionen und Duplikationen

Befunde mit direktem klinischem Nutzen

 Varianten im klinischen Kontext interpretiert, mit direkt verwertbaren Empfehlungen – erstellt von unserem interdisziplinären Team

Das Xtra in ExomeXtra®: Das Beste aus WES, WGS und Array-CGH in einem Test

Die Exom-Sequenzierung erfasst rund 85 % der derzeit bekannten krankheitsverursachenden Varianten – lässt jedoch die nicht-kodierenden Regionen außer Acht. In diesen wird heute eine beträchtliche Anzahl seltener Krankheitsursachen gefunden. Die Genom-Sequenzierung deckt einen größeren Bereich ab, verzichtet jedoch auf die für eine zuverlässige Variantenerkennung in klinisch relevanten Regionen erforderliche Tiefe. Eine geringere Sensitivität zugunsten einer größeren Breite ist für diagnostische Zwecke kein vertretbarer Kompromiss. Kopienzahlvarianten sorgen für eine weitere Dimension: Deletionen und Duplikationen sind eine gut erforschte Ursache seltener Erkrankungen.  Ihre zuverlässige Erkennung erfordert einen dedizierten Ansatz, den weder herkömmliche WES noch WGS durchgängig bieten.

ExomeXtra® ist die Antwort auf diese diagnostische Lücke: Es vereint die Tiefe der Exom-Sequenzierung (WES), die Reichweite der Genom-Sequenzierung (WGS) und eine zuverlässige CNV-Detektion – alles in einem einzigen Test. Darüber hinaus umfasst ExomeXtra® ein Infektionsscreening – für Ursachen, die genetisch wirken, aber auf eine Infektion zurückzuführen sind.

ExomeXtra® überzeugt in zweierlei Hinsicht: mehr Patienten mit einer Diagnose – und medizinische Berichte, die Ihren nächsten Schritt leiten.

1. Lösen Sie mehr Fälle mit ExomeXtra®

Finden Sie 20 % mehr krankheitsverursachende Varianten

ExomeXtra® erweitert das Analysefenster weit über die herkömmliche Exom-Diagnostik hinaus und bietet eine tiefere Analyse als die herkömmliche Genom-Diagnostik. Es liefert zusätzliche präzise Daten genau dort, wo sie klinisch zählen: in bekannten nicht-kodierenden Krankheitsregionen, bei zusätzlichen Variantenklassen wie Mosaiken und im mitochondrialen Genom – mit der für eine sichere Diagnose erforderlichen Sensitivität. Das Ergebnis: 20 % mehr erkannte krankheitsverursachende Varianten, basierend auf 2.600 realen Diagnostikfällen. Da viele Diagnosen den Nachweis von zwei Varianten erfordern,  können mit ExomeXtra® bis zu 25 % mehr Fälle gelöst werden.

Der Unterschied im Detail
  • >46,000 bekannte nicht-kodierende Krankheitsregionen (tief intronisch, regulatorisch)
  • Nicht-kodierende RNA-Gene
  • Mitochondriales Genom
  • Genomweite CNV-Grundstruktur
  • Kopienzahlveränderungen (CNVs)
  • Compound-heterozygote SNV/CNV-Kombinationen
  • Mosaikvarianten
  • Repeat Expansionen in 46 Genen
Daten und Methoden

2. Berichte mit direktem klinischem Mehrwert

Vom Befund zur Entscheidung

Jede Variante wird im Kontext des Phänotyps Ihrer Patientin oder Ihres Patienten bewertet. Sie erhalten einen medizinischen Bericht, den Sie direkt im Patientengespräch nutzen können, und keine Liste von Erkenntnissen, die Sie selbst interpretieren müssen.

Interpretierte Befunde. Direkt verwertbare Empfehlungen.

Wo die Befunde es unterstützen, enthält unser medizinischer Bericht konkrete nächste Schritte. Wir geben Ihnen damit einen klaren Weg für die weitere Behandlung Ihres Patienten vor.

Icon zur Darstellung von Analyseverfahren oder -prozessen
Umfassende Analyse der Varianteninteraktionen

Wir suchen aktiv nach Zusammenhängen zwischen Variantenklassen – einschließlich SNV/CNV-Kombinationen, einer Konstellation, die bei der Standarddiagnostik häufig übersehen wird.

Icon zur Darstellung von Zuverlässigkeit
Interdisziplinäre Expertise in jedem medizinischen Bericht

Jeder medizinische Bericht wird von einem interdisziplinären Team aus Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern sowie Fachärztinnen und Fachärzten für Humangenetik erstellt und überprüft – dabei wird bioinformatische Präzision mit klinischer Expertise kombiniert.

Die richtige Diagnosestrategie für Ihre Fälle: Trio ExomeXtra® als Erstlinien-Test

Grafik mit 4 Balken einer in Blau. Der Blaue Balken gehört zu TriExomeXtra Performance und steht im Vergleich zu anderen diganostischen Verfahren.

Die Datenlage ist eindeutig: Trio ExomeXtra® liefert die höchste diagnostische Ausbeute unter Exom-basierten Ansätzen – und übertrifft die herkömmliche Genom-Diagnostik als Erstlinien-Test. Im Vergleich zur reinen Index-Analyse erreicht die Trio-Diagnostik in mehreren unabhängigen Kohorten eine Steigerung der diagnostischen Ausbeute um 5–15 Prozentpunkte 1,2 – während der Wechsel von Exom- zu Genom-Sequenzierung typischerweise nur eine um 1–5 Prozentpunkte gesteigerte Ausbeute ergibt. Und das auf Kosten einer geringeren Sequenziertiefe und eines höheren Anteils an unklaren Ergebnissen. Mehr Daten bedeuten nicht mehr Antworten.

Wenn keine elterlichen Proben verfügbar sind, erreicht Single ExomeXtra® für die große Mehrheit der Variantenklassen eine mindestens vergleichbare diagnostische Ausbeute wie WGS – und detektiert zusätzlich Mosaikvarianten, die eine Sequenziertiefe jenseits der Reichweite der herkömmlichen Genom-Sequenzierung erfordern.

WGS ist eine wertvolle Zweitlinienoption, wenn balancierte strukturelle Varianten als krankheitsverursachend vermutet werden – die einzige Variantenklasse außerhalb des Anwendungsbereichs von ExomeXtra®. Für alle anderen diagnostischen Fragestellungen weist die Evidenz in eine eindeutige Richtung: Beginnen Sie mit Trio ExomeXtra®, um Ihren Patientinnen und Patienten diagnostische Antworten zu geben.

Herkömmliches WES

Herkömmliches WGS

DIAGNOSTISCHER UMFANG

Erfasste Region

Nur kodierend

Whole Genome, geringere Tiefe

Kodierend + nicht-kodierend

Kodierend + nicht-kodierend

Kurartierte List emit hohem Impact basieren auf ExomeXtra® Anreicherung

Kodierend + nicht-kodierend

CNV Detektion

Limitiert

Array-ähnlich

Array-ähnlich

Array-ähnlich

Array-ähnlich

Array-ähnlich

Untersuchung von Repeat-Expansionen

✓46 Gene

✓46 Gene

Detektion von Mosaizismen

✓

✓

✓

✓

Detektion von Strukturvarianten

SNV/CNV Kombinationen

Infektionsscreening

FAMILIENANALYSE

Parentale Daten enthalten

UPD Analyse

BEFUNDQUALITÄT

ACMG Klassifizierung

3/4/5

3/4/5

3/4/5

4/5

Manuelle Gen Auswahl

Klinische Handlungsempfehlungen

Reassessment-Service

ÜBERBLICK

Diagnostische Ausbeute

Kosten

€€€

€€

€€€

Diagnostikablauf

Icon Prozessablauf

Beratung & Auswahl des Tests

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Probenentnahme & Probenversand

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Analyse der Probe

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Befundübermittlung & Beratung

Häufig gestellte Fragen

Nachfolgend finden Sie Antworten auf die am häufigsten gestellten Fragen zu unserem Diagnostik-Angebot. Falls Ihre Frage hier nicht beantwortet wird oder Sie den besten diagnostischen Ansatz für Ihren Patienten besprechen möchten, kontaktieren Sie uns unter diagnostic-support@cegat.com – wir helfen Ihnen gerne weiter.

Über den diagnostischen Ansatz

ExomeXtra® und die Genom-Sequenzierung sind für unterschiedliche Zwecke konzipiert.  WGS deckt zwar das gesamte Genom ab, jedoch nur mit einer standardmäßigen klinischen Abdeckung: Fast die Hälfte der klinisch relevanten Regionen liegt unter der erforderlichen Tiefe für eine zuverlässige Variantenerkennung.

ExomeXtra® erzielt eine tiefere, gleichmäßigere Abdeckung dort, wo es klinisch relevant ist, erkennt Variantenklassen, die WGS nicht zuverlässig erfasst – einschließlich Mosaikvarianten – und liefert Befunde mit direkten klinischen Empfehlungen. Bei der Diagnose der großen Mehrheit seltener Erkrankungen übertrifft ExomeXtra® die WGS hinsichtlich der diagnostischen Ausbeute. Die WGS bleibt eine wertvolle Option der zweiten Wahl, wenn konkret strukturelle Varianten wie Translokationen, Insertionen oder Inversionen vermutet werden. Schauen Sie sich gerne unsere TechNote an und erhalten Sie einen detaillierten technischen Vergleich.

Ja, unsere CNV-Analyse erlaubt es uns, einzelne Exon-Deletionen mit einer Sensitivität von > 92 % zu identifizieren, größere Deletionen von drei oder mehr Exons werden mit > 96 % Sensitivität nachgewiesen. Wir integrieren die CNV-Analyse immer automatisch in alle unsere NGS-Analysen, auch bei SNV/CNV-Kombinationen. Dieser Service ist kostenlos.

Die mitochondriale DNA ist Teil unserer hauseigenen Exom-Anreicherung. So werden bei unseren Analysen auch alle mitochondrialen Gene sequenziert. Die Analyse der mitochondrialen Gene basiert auf der klinischen Beschreibung des Krankheitsbildes. Bei pränatalen Fällen wird die Analyse der mtDNA immer einbezogen, um mögliche Stoffwechselstörungen zu bestimmen.

Ja. Unsere Daten und Analysen decken alle klinisch relevanten, bekannten pathogenen und wahrscheinlichen pathogenen Varianten ab, wie z. B. nicht-kodierende Varianten in den flankierenden Regionen sowie tiefe intronische und intergenische Varianten.

Fragen, die die Trio Analyse betreffen

Die klassische Trio-Exom-Diagnostik liefert die vielversprechendsten Ergebnisse, wenn beide nicht betroffenen Elternteile in die Analyse einbezogen werden. Darüber hinaus hat CeGaT eine Methodik entwickelt für Fälle, bei denen ein Elternteil nicht verfügbar oder ähnlich betroffen ist wie die Indexpatientin, bzw. der Indexpatient. Die Einbeziehung weiterer Familienmitglieder ist ebenfalls möglich. Wenn Sie sich nicht sicher sind, welcher Ansatz für Ihre Patientinnen und Patienten am besten geeignet ist, kontaktieren Sie uns bitte unter diagnostic-support@cegat.de.

Ja, durch die Berücksichtigung von reduzierter Penetranz, variabler Expressivität und Imprinting-Effekten sind wir in der Lage, Fälle zu lösen, die bei der klassischen Trio-Exom-Analyse ungelöst bleiben.

Fragen zur Bestellung und Ablauf

Unsere Bearbeitungszeit beträgt typischerweise 2–3 Wochen nach Eingang der Probe in der Zentrale in Tübingen. Bei pränatalen Fällen oder anderen medizinischen Notfällen (z. B. Intensivstation) priorisieren wir immer den gesamten Prozess. Dieser Service ist kostenlos.

Nach dem deutschen Gendiagnostikgesetz müssen Patientinnen und Patienten vor sowie nach einem Gentest eine genetische Beratung erhalten. Daher können ausschließlich behandelnden Ärztinnen und Ärzte einen Gentest bei CeGaT anordnen. Nach Auswertung der Daten wird der medizinische Bericht an die einsendenden Ärztinnen und Ärzte übermittelt. So stellen wir sicher, dass Patientinnen und Patienten eine angemessene genetische Beratung erhalten.

Ja, natürlich. Wir unterstützen Sie gerne bei allen Fragen, die Ihre Patientinnen und Patienten betreffen. Dazu gehört sowohl die Empfehlung des für Sie geeignetsten Gentests als auch die Unterstützung bei der Interpretation unseres medizinischen Berichts und der genannten Empfehlungen. Bitte kontaktieren Sie uns unter diagnostic-support@cegat.de.

Fragen zur Probe

Wir empfehlen, 1–2 ml EDTA-Blut einzusenden. Wir sind darüber hinaus in der Lage, eine Vielzahl von Materialien wie Speichel, Wangenabstriche oder isolierte DNA zu untersuchen. Wir helfen Ihnen gerne bei Fragen zu alternativen Probenarten. Bitte kontaktieren Sie uns unter diagnostic-support@cegat.de.

CeGaT stellt auf Anfrage Probenversandboxen zur Verfügung. Diese Boxen können für den Transport verwendet werden und kostenfrei per Post oder Telefon angefordert werden. Die meisten Proben können bei Raumtemperatur aus der ganzen Welt verschickt werden. Weitere Informationen zum Probenversand, zu unseren Probeboxen und Anleitungen finden Sie hier.

Allgemeine Frage

CeGaTs ExomeXtra® ermöglicht die umfassendste genetische Diagnostik. Wenn ein Fall nicht gelöst werden konnte und eine strukturelle Variante als krankheitsverursachend vermutet wird, bietet CeGaT die WGS-Diagnostik als Zweitlinientest an.

Downloads

Einsendeformular Exom (DE)
Sample Report Single ExomeXtra®
Rare Disease Diagnostics Brochure
Rare Disease Diagnostics Flyer (EN)
Exome Diagnostics Tech Note (EN)
What Is the Real Diagnostic Benefi t of Whole-Genome Sequencing?

References

1 Malmgren H, Kvarnung M, et al. (2025) Diagnostic yield of 1000 trio analyses with exome and genome sequencing in a clinical setting. Front. Genet. 16:1580879. doi: 10.3389/fgene.2025.1580879
2 Farwell, Kelly D. et al. (2015) Enhanced utility of family-centered diagnostic exome sequencing with inheritance model–based analysis: results from 500 unselected families with undiagnosed genetic conditions. Genetics in Medicine (2015), Volume 17, Issue 7, 578 – 586
3 Retterer, Kyle et al. (2016) Clinical application of whole-exome sequencing across clinical indications. Genetics in Medicine, Volume 18, Issue 7, 696 – 704
4 Battke, F., Schulze, M., & Schulte, B. (2024). What Is the Real Diagnostic Benefit of Whole-Genome Sequencing?. Preprints. https://doi.org/10.20944/preprints202412.0023.v1

Unsere Akkreditierungen

Verbindliche Standards gewährleisten die Qualität unserer Arbeit: Unsere Laborleistung ist nach CAP/CLIA und DIN EN ISO 15189 akkreditiert. Weitere Akkreditierung  und Zertifizierungen finden Sie hier.

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