CeGaT bietet die Sequenzierung von individuell erstellten Librarys an, die mit Illumina- oder PacBio-Systemen kompatibel sind. Dabei setzen wir die neuesten Sequenziertechnologien ein. Je nach Bedarf werden die Proben entweder auf Illumina Short-Read-Plattformen, wie dem NovaSeq X Plus, NovaSeq 6000 oder MiSeq, oder auf dem PacBio Sequel IIe Long-Read-System sequenziert.
Es stehen flexible Sequenzieroptionen zur Verfügung, die speziell auf Ihr Projekt zugeschnitten sind. Weitere Einzelheiten entnehmen Sie bitte unseren technischen Informationen.
CeGaT ist der beste Partner für Ihr Sequenzierprojekt
Unser Engagement für Sie
Schnelle Bearbeitung
Bearbeitungszeit
≤ 15 Werktage
Hohe Qualität
Höchste Genauigkeit bei allen Prozessen
Sichere Datenlieferung
Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten über hausinterne Server
Sichere Aufbewahrung
Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss
Unser Service
Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig − von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen während des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.
Unser Service umfasst:
- Ausführliche Projektberatung
- Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
- Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
- Abschließender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualität, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen
Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsabläufen.
Unser Produktportfolio für Ready to Load Sequencing
Wir bieten verschiedene Ready-to-Load-Sequenzieroptionen für eine Vielzahl von Forschungsfragen an. Es stehen verschiedene Systeme, Flow cells und Sequenzieroptionen zur Verfügung.
NovaSeq X Plus Plattform (Illumina)
10B Flow cell |
SR/PE 200 Zyklen 2000 Gb |
SR/PE 300 Zyklen 3000 Gb |
SR: Single-Read; PE: Paired-End
NovaSeq 6000 Plattform (Illumina)
SP Flow cell | S1 Flow cell | S2 Flow cell | S4 Flow cell |
SR/PE 100 Zyklen 65 Gb 650 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 100 Zyklen 134 Gb 1330 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 100 Zyklen 333 Gb 3335 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 200 Zyklen 1600 Gb 8000 Millionen Single-Reads CPF* |
SR/PE 200 Zyklen 134 Gb 650 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 200 Zyklen 266 Gb 1330 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 200 Zyklen 667 Gb 3335 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 300 Zyklen 2400 Gb 8000 Millionen Single-Reads CPF* |
SR/PE 300 Zyklen 200 Gb 650 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 300 Zyklen 400 Gb 1330 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 300 Zyklen 1000 Gb 3335 Millionen Single-Reads CPF* | |
PE 500 Zyklen 325 Gb 650 Millionen Single-Reads CPF* |
SR: Single-Read; PE: Paired-End; CPF: Clusters Passing Filter
*Im Falle der PE-Sequenzierung ist die Zahl doppelt so hoch.
MiSeq Plattform (Illumina)
Nano Flow cell | Micro Flow cell | V2 Flow cell | V3 Flow cell |
SR/PE 300 Zyklen 0,3 Gb 1 Million Single-Reads CPF* | SR/PE 300 Zyklen 1,2 Gb 4 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 50 Zyklen 0,75 Gb 12 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 150 Zyklen 3,3 Gb 22 Millionen Single-Reads CPF* |
PE 500 Zyklen 0,5 Gb 1 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 300 Zyklen 4,5 Gb 12 Millionen Single-Reads CPF* | SR/PE 600 Zyklen 13,2 Gb 22 Millionen Single-Reads CPF* | |
PE 500 Zyklen 7,5 Gb 12 Millionen Single-Reads CPF* |
SR: Single-Read; PE: Paired-End; CPF: Clusters Passing Filter
*Im Falle der PE-Sequenzierung ist die Zahl doppelt so hoch.
Sequel IIe Plattform (PacBio)
SMRT Cell 8M |
Movie Time – 10-30 Std. (abhängig von der Insert-Länge) 3 Millionen HiFi Reads Abhängig von der Länge des Library-Inserts, der Movie Time und der Probenqualität. |
Bioinformatik
Je nach verwendeter Sequenzierplattform unterscheiden sich die gelieferten Datenformate. Für Short-Read-Sequenzierprojekte erhalten Sie entweder Rohdaten als BCL-Dateien oder FASTQ-Dateien nach dem Demultiplexing. Falls erforderlich kann ein Adapter-Trimming durchgeführt werden. Bei Sequenzierprojekten, die mit dem PacBio-System durchgeführt werden, erhalten Sie HiFi Reads als geklippte BAM-Dateien oder FASTQ-Dateien.
Technische Information
Die Sequenzierung wird bei uns mit Illumina- oder PacBio-Sequenzierplattformen durchgeführt. Für Sequenzierprojekte auf den Illumina-Plattformen akzeptieren wir jede kompatible Library. Dabei können Sie sowohl Illumina-Index-Sequenzierprimer als auch Ihre eigenen Primer verwenden. Wenn Sie die Zielmoleküle für die Library mit einem kommerziellen, PCR-basierten Kit für Unique Molecular Identifier (UMIs) generiert haben, können wir die Sequenzierung mit angepassten Sequenzierparametern anbieten. Die Längen von Read 1 und Read 2, sowie die Index-Leselängen, können an Ihre Bedürfnisse angepasst werden.
Für die Durchführung von HiFi-Long-Read-Sequenzierprojekten akzeptieren wir Sequenzier-Librarys, die mit dem SMRTbell Prep Kit 3.0 hergestellt wurden. Wenn Sie möchten, dass wir die Vorbereitung der SMRTbell-Library mit Ihren fertigen DNA-Proben (gescherte/ gereinigte DNA) durchführen, teilen Sie uns dies bitte mit, damit wir die Möglichkeiten besprechen können.
Entdecken Sie unser Ready-to-Load-Sequencing-Produktportfolio mit verschiedenen Sequenzieroptionen für Ihre Sequenzier-Library. Abhängig von der Batch-Größe, dem gewünschten Output und den Spezifikationen für die Read-Anzahl können Sie aus unserem Portfolio frei wählen.
Kontaktieren Sie uns
Sie haben noch Fragen oder Interesse an unserem Service? Treten Sie gern mit uns in Kontakt. Wir werden uns schnellstmöglich um Ihr Anliegen kümmern.
Starten Sie Ihr Projekt mit uns
Gerne beraten wir Sie zu unseren Sequenzierdienstleitungen und erarbeiten mit Ihnen gemeinsam die beste Lösung, die auf Ihre klinische Studie oder Forschungsprojekt abgestimmt ist.
Bitte geben Sie, falls möglich, folgende Probeninformationen an: Ausgangsmaterial, Anzahl der Proben, bevorzugte Option für die Vorbereitung der Library, bevorzugte Sequenziertiefe und gewünschte bioinformatische Analysestufe.
