Der T-Zell-Rezeptor („T-cell receptor“, TCR) befindet sich auf der Oberflรคche von T-Zellen. Er ist wichtig fรผr die Erkennung von Antigenen, die von den Molekรผlen des Haupthistokompatibilitรคtskomplexes („major histocompatibility complex“, MHC) auf Antigen-prรคsentierenden Zellen dargeboten werden. Durch somatische Neuanordnungen exprimieren T-Zellen eine breite Palette einzigartiger Rezeptoren. Diese sehr diversen Heterodimere bestehen meist aus zwei Untereinheiten, der ฮฑ- und ฮฒ-Kette. Zu einem geringen Prozentsatz bestehen die Heterodimere aber auch aus einer ฮณ- und ฮด-Kette. Die ฮฑ- und ฮณ-Ketten des TCR entstehen durch V/J-Rekombination, die aus zufรคlligen Umlagerungen der variablen (V) und verbindenden („joining“, J) Gene resultiert. Die ฮฒ- und ฮด-Ketten entstehen durch V/D/J-Rekombination, die zusรคtzlich die Diversitรคtsgene (D) einschlieรen.
Das individuelle T-Zell-Rezeptor-Repertoire wird also durch V/D/J-Rekombination geformt. Das Ergebnis dieser Rekombination ist eine besonders diverse Antigenbindungsstelle, die auch Complementarity-determining Region 3 (CDR3) genannt wird. Diese Region ist ein attraktives Ziel, um die Vielfalt des TCR-Repertoires zu bewerten, da sie fรผr jede TCR-ฮฒ-Variante einzigartig ist.
Die Untersuchung des TCR-Repertoires:
- liefert Einblicke in die Funktionen von T-Zellen bei der Immunantwort, z. B. bei der Immunsuppression,
- ermรถglicht das รberwachen von Arzneimitteltherapien, wie z. B. Immuntherapien bei Krebs, und der damit verbundenen Verรคnderung des T-Zell-Status,
- und hilft die personalisierte Medizin durch die Analyse tumor-infiltrierender T-Zellen zu verbessern.
Wir bieten TCR Sequencingย zur Untersuchung des T-Zell-Rezeptor-Repertoires an. Wir liefern Informationen รผber Diversitรคt, Klonalitรคt und Verรคnderungen im TCR-Repertoire oder einzelner TCR-Klone (TCR Clone Tracking) zu unterschiedlichen Zeitpunkten.
CeGaT ist der beste Partner fรผr Ihr Sequenzierprojekt
Unser Engagement fรผr Sie
Schnelle Bearbeitung
Bearbeitungszeit
โค 15 Werktage
Hohe Qualitรคt
Hรถchste Genauigkeit bei allen Prozessen
Sichere Datenlieferung
Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten รผber hausinterne Server
Sichere Aufbewahrung
Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss
Unser Service
Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig โ von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen wรคhrend des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.
Unser Service umfasst:
- Ausfรผhrliche Projektberatung
- Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
- Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
- Abschlieรender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualitรคt, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen
Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsablรคufen.
Unser Produkt fรผr T-Cell Receptor Sequencing
Wir bieten T-Cell Receptor Sequencing (TCR) auf RNA-Ebene an, um Sie bei einer Vielzahl von Forschungsfragen zu unterstรผtzen. Wรผnschen Sie zusรคtzlich zu den beinhalteten Leistungen bioinformatische Analysen Ihrer Daten? Jedes unserer Produkte kann durch weitere Dienstleistungen ergรคnzt werden. Wir beraten Sie gerne.
TCR RNA |
Spezies |
Probenart Sortierte Zellen, PBMCs, Vollblut, frisch eingefrorenes Gewebe, FFPE-Gewebe, isolierte RNA |
Ziel |
Ziel-Untereinheit |
Sequenzierplattform |
Output |
Beinhaltete Leistungen |
Bioinformatik
Die Rohdaten der Sequenzierung werden automatisch verarbeitet. Wir bieten verschiedene Level bioinformatischer Analysen an. Das Standardlevel ist Level 1. Mit steigendem Bioinformatiklevel werden mehr Daten geliefert. Alle hรถheren Level beinhalten dabei die Daten der vorherigen Level. Zusรคtzlich zu den Daten und unabhรคngig vom Analyselevel wird ein Projektbericht verfasst.
Level 1:
- Demultiplexing und Adapter-Trimming der Sequenzierdaten (FASTQ-Datei)
Level 2:
- Rekonstruktion der TCR-Klone
- Beurteilung von Klonalitรคt und Diversitรคt (TSV- und PNG-Datei)
Weitere Optionen fรผr bioinformatische Analysen sind auf Anfrage erhรคltlich, darunter:
- TCR-Klon-Tracking
- Verรคnderungen des Repertoires รผber mehrere Zeitpunkte hinweg
Technische Information
Wir bieten T-Cell Receptor Sequencing der CD3-Region der TCR ฮฒ-Kette an. TCR RNA gibt Aufschluss รผber das Expressionsniveau des TCR-Repertoires.
Bei CeGaT wird die Paired-End-Sequenzierung (2 x 100 bp) mit den Sequenzierplattformen von Illumina durchgefรผhrt. Wenn Sie andere Sequenzierparameter benรถtigen, lassen Sie es uns gerne wissen! Wir kรถnnen Ihnen weitere Lรถsungen anbieten.
Weitere Informationen zu T-Cell Receptor Sequencing
Der T-Zell-Rezeptor wurde erstmals in den 1980er Jahren mit Hilfe monoklonaler Antikรถrper isoliert. Seitdem wird seine Funktion im menschlichen Kรถrper untersucht. Der T-Zell-Rezeptor ist ein heterodimerer Proteinkomplex, der aus einer ฮฑ- und einer ฮฒ-Kette besteht. Diese beiden Ketten sind รผber eine Disulfidbrรผcke verbunden und bilden eine Antigenbindungsstelle im extrazellulรคren Raum. Neben der ฮฑ- und ฮฒ-Kette bilden die variable Region (V-Region), die konstante Region (C-Region), das Transmembranprotein CD3 und zwei ฮถ-Polypeptide (Zeta) den finalen T-Zell-Rezeptor-Komplex. Nur etwa 5ย % aller menschlichen T-Zell-Rezeptoren bestehen nicht aus einer ฮฑ- und einer ฮฒ-Kette, sondern aus einer ฮณ- und einer ฮด-Kette.
Die Loci, die fรผr die ฮฑ- und ฮฒ-Kette des T-Zell-Rezeptors kodieren, befinden sich auf den Chromosomen 14 bzw. 7. Jede dieser Ketten wird von Loci kodiert, die mehrere Gensegmente enthalten: V und J fรผr die ฮฑ-Kette und V, D, und J fรผr die ฮฒ-Kette. Jedes Gensegment ist in verschiedenen Versionen vorhanden. Bei der somatischen Rekombination werden die Segmente zufรคllig ausgewรคhlt und kombiniert. Wรคhrend des Rekombinationsschritts kรถnnen Basen hinzugefรผgt oder gelรถscht werden, was die Vielfalt noch weiter erhรถht. Jede reife T-Zelle hat genau eine rekombinierte ฮฑ- und ฮฒ-Kette. Beide Ketten werden unabhรคngig voneinander transkribiert und รผbersetzt.
Anschlieรend werden sie miteinander verbunden, um einen vollstรคndigen T-Zell-Rezeptor zu bilden. Die variable Region, die durch somatische Rekombination entsteht, ist direkt an der Antigenbindung beteiligt.
Die Gesamtheit aller T-Zell-Rezeptoren in einer Probe wird auch als T-Zell-Rezeptor-Repertoire bezeichnet. Die Analyse dieses T-Zell-Rezeptor-Repertoires hat ein breites Spektrum an Auswirkungen und Anwendungen. Die Sequenzierung von T-Zell-Rezeptoren („T-cell receptor sequencing“) kann das Verstรคndnis verschiedener Krankheiten wie Krebs, Infektionskrankheiten, Autoimmunerkrankungen oder Alterungsprozesse verbessern. Die Sequenzierung der T-Zell Rezeptoren kann Einblicke in die Funktion von T-Zellen geben, zum Beispiel im Zusammenhang mit Immunsuppression. Darรผber hinaus kann die Sequenzierung von T-Zell-Rezeptoren zur รberwachung von Arzneimitteltherapie eingesetzt werden, z. B. im Zusammenhang mit Krebs. Ein Anwendungsbeispiel fรผr die รberwachung von Arzneimitteltherapien durch T-Zell-Rezeptor-Sequenzierung sind Krebsbehandlungen, z. B. Immuntherapien, und damit verbundene Verรคnderungen des T-Zell-Rezeptor-Status. Darรผber hinaus werden durch die T-Zell-Rezeptor-Sequenzierung Ansรคtze der personalisierten Medizin erleichtert.
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Bitte geben Sie, falls mรถglich, folgende Probeninformationen an: Ausgangsmaterial, Anzahl der Proben, bevorzugte Option fรผr die Vorbereitung der Library, bevorzugte Sequenziertiefe und gewรผnschte bioinformatische Analysestufe.
