Liquid Biopsy

Nutzen Sie die vielfältigen Möglichkeiten von Liquid Biopsy

Die blutbasierte Analyse von zirkulierenden Tumorzellen oder von Nukleinsäuren, die vom Tumor stammen, wird als Liquid Biopsy (Flüssigbiopsie) bezeichnet. Das Hauptziel dieser Methode ist die Analyse zellfreier DNA (“cell-free DNA”, cfDNA), die von nekrotischen und apoptotischen Zellen in den Blutkreislauf abgegeben wird. Erhöhte Werte von cfDNA können bei Patientinnen und Patienten mit Krebs und anderen Erkrankungen festgestellt werden. Da nur ein kleiner Teil der zirkulierenden DNA aus dem Tumor stammt (“circulating tumor DNA”, ctDNA), sind hochsensible Nachweisverfahren erforderlich.

Die Anwendungsmöglichkeiten von Liquid Biopsys sind vielfältig und weisen gegenüber der konventionellen Gewebeanalyse deutliche Vorteile auf: Unter anderem basiert die Analyse von Liquid Biopsys auf einer einfachen Blutentnahme und kann daher leicht wiederholt werden.

Anwendungsbereiche von Liquid Biopsys sind:

  • Überwachung von Tumorerkrankungen
  • Überwachung des Therapieansprechens
  • Stratifizierung von Patientinnen und Patienten sowie deren Behandlungsauswahl
  • Nachweis einer minimalen Resterkrankung
  • frühzeitige Erkennung und Profiling einer Therapieresistenz

Wir bieten verschiedene Liquid-Biopsy-Produkte an, um zuverlässige und genaue Einblicke in die zellfreie DNA zu erhalten.

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CeGaT ist der beste Partner für Ihr Sequenzierprojekt

Hohe
Flexibilität

Skalierbar für unterschiedliche Probenarten, Probenmengen und Probenanforderungen

Akkreditierte
Verfahren

Bearbeitung nach
höchsten Qualitätsstandards

Hervorragender Kundenservice

Wissenschaftliche Begleitung bei allen Projektschritten

Qualität aus Deutschland

Hausinterne Bearbeitung aller Proben zur Einhaltung unserer zuverlässigen und bewährten Qualität

Unser Engagement für Sie

Schnelle Bearbeitung

Bearbeitungszeit
≤ 15 Werktage

Hohe Qualität

Höchste Genauigkeit bei allen Prozessen

Sichere Datenlieferung

Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten über hausinterne Server

Sichere Aufbewahrung

Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss

Unser Service

Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig − von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen während des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.

Unser Service umfasst:

  • Ausführliche Projektberatung
  • Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
  • Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
  • Abschließender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualität, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen

Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsabläufen.

Unser Produktportfolio für Liquid Biopsy

Wir bieten verschiedene Liquid-Biopsy (LB)-Produkte für eine Vielzahl von Forschungsfragen an. Wenn Sie LB Target wählen, entscheiden Sie sich für einen ddPCR-Ansatz (“droplet digital PCR”, ddPCR). Dieser Ansatz eignet sich besonders für die Überwachung einzelner Genvarianten. LB Focus zielt auf ausgewählte krebsassoziierte Gene ab. Bei diesem Next-Generation-Sequencing-basierten Ansatz wird ein von CeGaT entwickeltes Gen-Panel verwendet. Wenn Sie sich für LB Exploratory entscheiden, erhalten Sie ein umfassendes genomisches Profiling von cfDNA, unter Verwendung des TSO500 ctDNA Assays von Illumina. Für LB Flex kann entweder das gesamte Exom oder ein vordefiniertes Set an Genen analysiert werden.

Wünschen Sie zusätzlich zu den beinhalteten Leistungen bioinformatische Analysen Ihrer Daten? Jedes unserer Produkte kann durch weitere Dienstleistungen ergänzt werden. Wir beraten Sie gerne.

LB Target

LB Focus

LB Exploratory

LB Flex

Spezies
Mensch

Spezies
Mensch

Spezies
Mensch

Spezies
Mensch

Ausgangsmaterial
Vollblut (z. B. Streck®-Röhrchen), Plasma, andere Körperflüssigkeiten, isolierte Nukleinsäuren

Ausgangsmaterial
Vollblut (z. B. Streck®-Röhrchen), Plasma, andere Körperflüssigkeiten, isolierte Nukleinsäuren

Ausgangsmaterial
Vollblut (z. B. Streck®-Röhrchen), Plasma, andere Körperflüssigkeiten, isolierte Nukleinsäuren

Ausgangsmaterial
Vollblut (z. B. Streck®-Röhrchen), Plasma, andere Körperflüssigkeiten, isolierte Nukleinsäuren

Ziel
Einzelne Genvarianten

Ziel
Gen-Panel aus 36 Genen
(15,15 Kb)

Ziel
Gen-Panel aus 523 Genen
(1,94 Mb)

Ziel
Variabel (Exom oder Panel)

Technologie
ddPCR Analyse
(kommerziell verfügbare Assays oder kundenspezifische Lösungen)

Technologie
NGS-Analyse

Technologie
NGS-Analyse

Technologie
NGS-Analyse

Bioinformatik-Pipeline
k. A.

Bioinformatik-Pipeline
Bioinformatik-Pipeline von CeGaT

Bioinformatik-Pipeline
Bioinformatik-Pipeline von TSO500 (Illumina)

Bioinformatik-Pipeline
Illumina DRAGEN Bio-IT Plattform

Duplex-UMIs
k. A.

Duplex-UMIs
Ja

Duplex-UMIs
Ja

Duplex-UMIs
Nein

Variantentyp
SNVs

Variantentyp
SNVs und Indels

Variantentyp
SNVs und Indels, DNA-Fusionen, CNVs, MSI, TMB

Variantentyp
SNVs und Indels

Beinhaltete Leistungen
Projektbericht, DDPCR, GLP

Beinhaltete Leistungen
Projektbericht, Dateien im FASTQ-, BAM-, VCF- & TSV-Format

Beinhaltete Leistungen
Projektbericht & TMB/MSI-Bericht, Dateien im FASTQ-, BAM-, VCF- & TSV-Format

Beinhaltete Leistungen
Projektbericht & Dateien im FASTQ-Format

Bioinformatik

Für LB Target sind die Ergebnisse der ddPCR als Rohdaten (DDPCR, QLP-Dateien) und verarbeitete XLSX-Dateien (Kopien/µl, Tröpfchenanzahl usw.) verfügbar. Zusätzlich zu den Daten wird ein Projektbericht erstellt (PDF-Datei).

Für LB Focus werden die sequenzierten Rohdaten (FASTQ-Datei) automatisch auf Basis unserer eigenen Bioinformatik-Pipeline verarbeitet. Die Analyse von LB Focus beinhaltet das Alignment der getrimmten Daten (BAM-Datei), sowie die Bestimmung und Annotation von Einzelnukleotid-Varianten (Single nucleotide variants, kurz SNVs) und kleine Insertionen und Deletionen (kurz Indels) (VCF- und TSV-Dateien). Zusätzlich zu den Daten wird ein Projektbericht erstellt (PDF-Datei).

Für LB Exploratory werden die sequenzierten Rohdaten (FASTQ-Datei) automatisch auf Basis der TSO500-Pipeline (Illumina) verarbeitet. Die Analyse für LB Exploratory umfasst das Alignment der getrimmten Sequenzierdaten (BAM-Datei), die Bestimmung und Annotation von Einzelnukleotid-Varianten (Single nucleotide variants, SNVs) und kleinen Insertionen und Deletionen (Indels) sowie von Fusionen (VCF-, TSV- und JSON-Dateien). Darüber hinaus werden Kopienzahlveränderungen (Copy number variations, CNVs) (VCF-Datei) und der MSI/TMB-Status ausgewertet (TSV-Datei). Zusätzlich zu den Daten wird ein Projektbericht erstellt (PDF-Datei).

Grafik Liquid Biopsy

Für LB Flex werden die Rohdaten automatisch mit der DRAGEN Bio-IT Plattform verarbeitet. Wir bieten verschiedene Level bioinformatischer Analysen für LB Flex an. Das Standardlevel ist Level 1. Mit steigendem Bioinformatiklevel werden mehr Daten geliefert. Alle höheren Level beinhalten dabei die Daten der vorherigen Level. Zusätzlich zu den Daten und unabhängig vom Analyselevel wird ein Projektbericht verfasst.

Level 1:

  • Demultiplexing und Adapter-Trimming der Sequenzierdaten (FASTQ-Datei)
  • Metriken (CSV-Datei)
  • MultiQC-Bericht (HTML-Datei)

Level 2:

  • Mapping der Sequenzierdaten (BAM-Datei)
  • Metriken (CSV-Datei)

Level 3:

  • Bestimmung von Einzelnukleotid-Varianten (Single nucleotide variants, kurz SNVs) und kleinen Insertionen und Deletionen (kurz Indels) (VCF-Datei)
  • Metriken (CSV-Datei)

Level 4:

  • Annotation von SNVs und Indels (JSON- und TSV-Datei)
Die verschiedenen Level bioinformatischer Analysen für LB Flex

Technische Information

Bei CeGaT wird die ddPCR mit dem QX200 Droplet Digital PCR System (Bio-Rad) durchgeführt. Die Paired-End-Sequenzierung (2 x 100 bp) wird mit den Sequenzierplattformen von Illumina durchgeführt. Wenn Sie andere Sequenzierparameter benötigen, lassen Sie es uns gerne wissen! Wir können Ihnen weitere Lösungen anbieten.

Genverzeichnis für LB Focus, LB Exploratory und LB Flex (Panel)

AKT1, ALK, ARAF, BRAF, CTNNB1, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, GNAS, H3-3A, H3-3B, HRAS, IDH1, IDH2, JAK2, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, MYCN, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, RAC1, RAF1, RET, STAT5B, TERT, TP53

ABL1, ABL2, ACVR1, ACVR1B, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ALOX12B, ANKRD11, ANKRD26, APC, AR, ARAF, ARFRP1, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARID5B, ASXL1, ASXL2, ATM, ATR, ATRX, AURKA, AURKB, AXIN1, AXIN2, AXL, B2M, BAP1, BARD1, BBC3, BCL10, BCL2, BCL2L1, BCL2L11, BCL2L2, BCL6, BCOR, BCORL1, BCR, BIRC3, BLM, BMPR1A, BRAF, BRCA1a, BRCA2a, BRD4, BRIP1, BTG1, BTK, C11orf30, CALR, CARD11, CASP8, CBFB, CBL, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CD274, CD276, CD74, CD79A, CD79B, CDC73, CDH1, CDK12, CDK4, CDK6, CDK8, CDKN1A, CDKN1B, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CEBPA, CENPA, CHD2, CHD4, CHEK1, CHEK2, CIC, CREBBP, CRKL, CRLF2, CSF1R, CSF3R, CSNK1A1, CTCF, CTLA4, CTNNA1, CTNNB1, CUL3, CUX1, CXCR4, CYLD, DAXX, DCUN1D1, DDR2, DDX41, DHX15, DICER1, DIS3, DNAJB1, DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, DOT1L, E2F3, EED, EGFL7, EGFR, EIF1AX, EIF4A2, EIF4E, EML4, EP300, EPCAM, EPHA3, EPHA5, EPHA7, EPHB1, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERG, ERRFI1, ESR1, ETS1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EZH2, FAM123B, FAM175A, FAM46C, FANCA, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FAS, FAT1, FBXW7, FGF1, FGF8, FGF9, FGF10, FGF14, FGF19, FGF2, FGF23, FGF3, FGF4, FGF5, FGF6, FGF7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FH, FLCN, FLI1, FLT1, FLT3, FLT4, FOXA1, FOXL2, FOXO1, FOXP1, FRS2, FUBP1, FYN, GABRA6, GATA1, GATA2, GATA3, GATA4, GATA6, GEN1, GID4, GLI1, GNA11, GNA13, GNAQ, GNAS, GPR124, GPS2, GREM1, GRIN2A, GRM3, GSK3B, H3F3A, H3F3B, H3F3C, HGF, HIST1H1C, HIST1H2BD, HIST1H3A, HIST1H3B, HIST1H3C, HIST1H3D, HIST1H3E, HIST1H3F, HIST1H3G, HIST1H3H, HIST1H3I, HIST1H3J, HIST2H3A, HIST2H3C, HIST2H3D, HIST3H3, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HNF1A, HNRNPK, HOXB13, IGF1, IGF1R, IGF2, IKBKE, IKZF1, IL10, IL7R, INHA, HRAS, HSD3B1, HSP90AA1, ICOSLG, ID3, IDH1, IDH2, IFNGR1, INHBA, INPP4A, INPP4B, INSR, IRF2, IRF4, IRS1, IRS2, JAK1, JAK2, JAK3, JUN, KAT6A, KDM5A, KDM5C, KDM6A, KDR, KEAP1, KEL, KIF5B, KIT, KLF4, KLHL6, KMT2B, KMT2C, KMT2D, KRAS, LAMP1, LATS1, LATS2, LMO1, LRP1B, LYN, LZTR1, MAGI2, MALT1, MAP2K1, MAP2K2, MAP2K4, MAP3K1, MAP3K13, MAP3K14, MAP3K4, MAPK1, MAPK3, MAX, MCL1, MDC1, MDM2, MDM4, MED12, MEF2B, MEN1, MET, MGA, MITF, MLH1, MLL, MLLT3, MPL, MRE11A, MSH2, MSH3, MSH6, MST1, MST1R, MTOR, MUTYH, MYB, MYC, MYCL1, MYCN, MYD88, MYOD1, NAB2, NBN, NCOA3, NCOR1, NEGR1, NF1, NF2, NFE2L2, NFKBIA, NKX2-1, NKX3-1, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, NPM1, NRAS, NRG1, NSD1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUP93, NUTM1, PAK1, PAK3, PAK7, PALB2, PARK2, PARP1, PAX3, PAX5, PAX7, PAX8, PBRM1, PDCD1, PDCD1LG2, PDGFRA, PDGFRB, PDK1, PDPK1, PGR, PHF6, PHOX2B, PIK3C2B, PIK3C2G, PIK3C3, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R3, PIM1, PLCG2, PLK2, PMAIP1, PMS1, PMS2, PNRC1, POLD1, POLE, PPARG, PPM1D, PPP2R1A, PPP2R2A, PPP6C, PRDM1, PREX2, PRKAR1A, PRKCI, PRKDC, PRSS8, PTCH1, PTEN, PTPN11, PTPRD, PTPRS, PTPRT, QKI, RAB35, RAC1, RAD21, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD52, RAD54L, RAF1, RANBP2, RARA, RASA1, RB1, RBM10, RECQL4, REL, RET, RFWD2, RHEB, RHOA, RICTOR, RIT1, RNF43, ROS1, RPS6KA4, RPS6KB1, RPS6KB2, RPTOR, RUNX1, RUNX1T1, RYBP, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SETBP1, SETD2, SF3B1, SH2B3, SH2D1A, SHQ1, SLIT2, SLX4, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, SMARCD1, SMC1A, SMC3, SMO, SNCAIP, SOCS1, SOX10, SOX17, SOX2, SOX9, SPEN, SPOP, SPTA1, SRC, SRSF2, STAG1, STAG2, STAT3, STAT4, STAT5A, STAT5B, STK11, STK40, SUFU, SUZ12, SYK, TAF1, TBX3, TCEB1, TCF3, TCF7L2, TERC, TERT, TET1, TET2, TFE3, TFRC, TGFBR1, TGFBR2, TMEM127, TMPRSS2, TNFAIP3, TNFRSF14, TOP1, TOP2A, TP53, TP63, TRAF2, TRAF7, TSC1, TSC2, TSHR, U2AF1, VEGFA, VHL, VTCN1, WISP3, WT1, XIAP, XPO1, XRCC2, YAP1, YES1, ZBTB2, ZBTB7A, ZFHX3, ZNF217, ZNF703, ZRSR2

AAK1, ABCB1, ABCG2, ABL1, ABL2, ABRAXAS1, ACD, ACVR1, ADGRA2, ADRB1, ADRB2, AIP, AIRE, AJUBA, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ALOX12B, AMER1, ANKRD26, APC, APLNR, APOBEC3A, APOBEC3B, AR, ARAF, ARHGAP35, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARID5B, ASXL1, ASXL2, ATM, ATR, ATRX, AURKA, AURKB, AURKC, AXIN1, AXIN2, AXL, B2M, BAP1, BARD1, BAX, BCHE, BCL10, BCL11A, BCL11B, BCL2, BCL3, BCL6, BCL9, BCL9L, BCOR, BCORL1, BCR, BIRC2, BIRC3, BIRC5, BLM, BMI1, BMPR1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRD3, BRD4, BRD7, BRIP1, BTK, BUB1B, CALR, CAMK2G, CARD11, CASP8, CBFB, CBL, CBLB, CBLC, CCDC6, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CD274, CD79A, CD79B, CD82, CDC73, CDH1, CDH11, CDH2, CDH5, CDK1, CDK12, CDK4, CDK5, CDK6, CDK8, CDKN1A, CDKN1B, CDKN1C, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CEBPA, CENPA, CEP57, CFTR, CHD1, CHD2, CHD4, CHEK1, CHEK2, CIC, CIITA, CKS1B, CNKSR1, COL1A1, COMT, COQ2, CREB1, CREBBP, CRKL, CRLF2, CRTC1, CSF1R, CSF3R, CSMD1, CSNK1A1, CTCF, CTLA4, CTNNA1, CTNNB1, CTR9, CTRC, CUX1, CXCR4, CYLD, CYP1A2, CYP2A7, CYP2B6, CYP2C19, CYP2C8, CYP2C9, CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, CYP4F2, DAXX, DCC, DDB2, DDR1, DDR2, DDX11, DDX3X, DDX41, DEK, DHFR, DICER1, DIS3L2, DNMT1, DNMT3A, DOT1L, DPYD, E2F3, EBP, EED, EFL1, EGFR, EGLN1, EGLN2, EIF1AX, ELAC2, ELF3, EME1, EML4, EMSY, EP300, EPAS1, EPCAM, EPHA2, EPHA3, EPHB4, EPHB6, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERG, ERRFI1, ESR1, ESR2, ETNK1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EXO1, EXT1, EXT2, EZH1, EZH2, FAN1, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FAS, FAT1, FBXO11, FBXW7, FEN1, FES, FGF10, FGF14, FGF19, FGF2, FGF23, FGF3, FGF4, FGF5, FGF6, FGF9, FGFBP1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FH, FLCN, FLI1, FLT1, FLT3, FLT4, FOXA1, FOXE1, FOXL2, FOXO1, FOXP1, FOXQ1, FRK, FRS2, FUBP1, FUS, FYN, G6PD, GALNT12, GATA1, GATA2, GATA3, GATA4, GATA6, GGT1, GLI1, GLI2, GLI3, GNA11, GNA13, GNAQ, GNAS, GNB3, GPC3, GPER1, GREM1, GRIN2A, GRM3, GSK3A, GSK3B, GSTP1, H3-3A, H3-3B, H3C2, HABP2, HCK, HDAC1, HDAC2, HDAC6, HGF, HIF1A, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA, DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRA, HLA-DRB1, HMGA2, HMGCR, HMGN1, HNF1A, HNF1B, HOXB13, HRAS, HSD3B1, HSP90AA1, HSP90AB1, HTR2A, ID2, ID3, IDH1, IDH2, IDO1, IFNGR1, IFNGR2, IGF1R, IGF2, IGF2R, IKBKB, IKBKE, IKZF1, IKZF3, IL1B, IL1RN, ING4, INPP4A, INPP4B, INPPL1, INSR, IRF1, IRF2, IRS1, IRS2, ITPA, JAK1, JAK2, JAK3, JUN, KAT6A, KDM5A, KDM5C, KDM6A, KDR, KEAP1, KIAA1549, KIF1B, KIT, KLF2, KLF4, KLHL6, KLLN, KMT2A, KMT2B, KMT2C, KMT2D, KRAS, KSR1, LATS1, LATS2, LCK, LIG4, LIMK2, LRP1B, LRRK2, LTK, LYN, LZTR1, MAD2L2, MAF, MAGI1, MAGI2, MAML1, MAP2K1, MAP2K2, MAP2K3, MAP2K4, MAP2K5, MAP2K6, MAP2K7, MAP3K1, MAP3K13, MAP3K14, MAP3K3, MAP3K4, MAP3K6, MAP3K8, MAPK1, MAPK11, MAPK12, MAPK14, MAPK3, MAX, MBD1, MBD4, MC1R, MCL1, MDC1, MDH2, MDM2, MDM4, MECOM, MED12, MEF2B, MEN1, MERTK, MET, MGA, MGMT, MITF, MLH1, MLH3, MLLT10, MLLT3, MN1, MPL, MRE11, MS4A1, MSH2, MSH3, MSH4, MSH5, MSH6, MSR1, MST1R, MTAP, MTHFR, MTOR, MT-RNR1, MTRR, MUC1, MUTYH, MXI1, MYB, MYC, MYCL, MYCN, MYD88, MYH11, MYH9, NAT2, NBN, NCOA1, NCOA3, NCOR1, NF1, NF2, NFE2L2, NFKB1, NFKB2, NFKBIA, NFKBIE, NIN, NKX2-1, NLRC5, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, NPM1, NQO1, NR1I3, NRAS, NRG1, NSD1, NSD2, NSD3, NT5C2, NTHL1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUMA1, NUP98, NUTM1, OBSCN, OPRM1, PAK1, PAK3, PAK4, PALB2, PALLD, PARP1, PARP2, PARP4, PAX3, PAX5, PAX7, PBK, PBRM1, PBX1, PDCD1, PDCD1LG2, PDGFA, PDGFB, PDGFC, PDGFD, PDGFRA, PDGFRB, PDK1, PDPK1, PGR, PHF6, PHOX2B, PIAS4, PIGA, PIK3C2A, PIK3C2B, PIK3C2G, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R3, PIM1, PLCG1, PLCG2, PLK1, PML, PMS1, PMS2, POLD1, POLE, POLH, POLQ, POT1, PPM1D, PPP2R1A, PPP2R2A, PREX2, PRKAR1A, PRKCA, PRKCI, PRKDC, PRKN, PRMT5, PRSS1, PSMB1, PSMB10, PSMB2, PSMB5, PSMB8, PSMB9, PSMC3IP, PSME1, PSME2, PSME3, PSPH, PTCH1, PTCH2, PTEN, PTGS2, PTK2, PTK7, PTPN11, PTPN12, PTPRC, PTPRD, PTPRS, PTPRT, RABL3, RAC1, RAC2, RAD21, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54B, RAD54L, RAF1, RALGDS, RARA, RASA1, RASAL1, RB1, RBM10, RECQL4, REST, RET, RFC2, RFWD3, RFX5, RFXANK, RFXAP, RHBDF2, RHEB, RHOA, RICTOR, RINT1, RIPK1, RIT1, RNASEH2B, RNASEL, RNF43, ROS1, RPS20, RPS6KB1, RPS6KB2, RPTOR, RSF1, RUNX1, RYR1, SAMHD1, SAV1, SBDS, SCG5, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SEC23B, SERPINB9, SETBP1, SETD2, SETDB1, SF3B1, SGK1, SH2B1, SH2B3, SHH, SIK2, SIN3A, SKP2, SLC19A1, SLC26A3, SLCO1B1, SLIT2, SLX4, SMAD3, SMAD4, SMARCA4, SMARCB1, SMARCE1, SMC1A, SMC3, SMO, SOCS1, SOS1, SOX11, SOX2, SOX9, SPEN, SPINK1, SPOP, SPRED1, SRC, SRD5A2, SRGAP1, SRSF2, SSTR2, SSX1, STAG1, STAG2, STAT1, STAT3, STAT5A, STAT5B, STK11, SUFU, SUZ12, SYK, TAF1, TAF15, TAP1, TAP2, TAPBP, TBK1, TBL1XR1, TBX3, TCF3, TCF4, TCL1A, TEK, TERC, TERF2IP, TERT, TET1, TET2, TFE3, TGFB1, TGFBR2, TMEM127, TMPRSS2, TNFAIP3, TNFRSF13B, TNFRSF14, TNFRSF8, TNFSF11, TNK2, TOP1, TOP2A, TP53, TP53BP1, TP63, TPMT, TPX2, TRAF2, TRAF3, TRAF5, TRAF6, TRAF7, TRIM28, TRRAP, TSC1, TSC2, TSHR, TTK, TYMS, U2AF1, UBE2T, UBR5, UGT1A1, UGT2B15, UGT2B7, UIMC1, UNG, USP9X, VEGFA, VEGFB, VHL, VKORC1, WRN, WT1, XIAP, XPA, XPC, XPO1, XRCC1, XRCC2, XRCC3, XRCC5, XRCC6, YAP1, YES1, ZFHX3, ZNF217, ZNF703, ZNRF3, ZRSR2

Unser Prozessablauf

Hier finden Sie den gesamten Prozessablauf

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Icon Prozessablauf

Support &
Angebot

Support & Angebot

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Icon Prozessablauf

Probeneingang & Qualitätskontrolle

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Vorbereitung der Library & Sequenzierung

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Icon Prozessablauf

Bioinformatische Analysen & Datenversand

Weitere Informationen zu Liquid Biopsy

Die Analyse der zellfreien Tumor-DNA hat gegenüber der herkömmlichen Gewebeanalyse mehrere entscheidende Vorteile:

  • Sie stellt immer ein aktuelles Bild der Erkrankung dar.
  • Sie gibt Aufschluss über die Heterogenität des gesamten Tumors und nicht nur eines kleinen Teils davon.
  • Sie basiert auf einer einfachen Blutentnahme. Das bedeutet, dass die Untersuchung patientenfreundlich, nicht-invasiv und leicht zu wiederholen ist.

Diese Vorteile eröffnen ein weites Einsatzspektrum. Im Folgenden werden wir Ihnen zwei mögliche Anwendungsbeispiele geben.

Für die Durchführung einer klinischen Studie, z. B. für ein neues Medikament, möchte man

  • die möglichen Wirkungen ermitteln,
  • Patientinnen und Patienten, die auf das Medikament ansprechen, identifizieren,
  • den dahinterstehenden Reaktionsmechanismus verstehen,
  • mögliche Biomarker identifizieren,
  • die Entwicklungsdynamik des Tumors verfolgen
  • und Resistenzmechanismen aufdecken.

Für diese Zwecke haben wir unser Liquid-Biopsy-Exploratory-Produkt entwickelt. Dieses Produkt umfasst die Analyse von mehr als 520 krebsassoziierten Genen sowie immunonkologischen Biomarkern. Es werden so genannte Unique Molecular Identifiers, kurz UMIs, verwendet.

Zusätzlich sequenzieren wir mit einer sehr hohen Sequenziertiefe. Somit kombiniert Liquid Biopsy Exploratory eine umfassende genomische Profilerstellung aus dem Plasma mit einer hohen Sensitivität.

Ein weiteres Anwendungsgebiet von Liquid Biopsy ist das Monitoring einer Tumorerkrankung und deren Therapieansprechen. Liquid Biopsys können eingesetzt werden, wenn der Tumor der erkrankten Person und die Treibermutationen bereits analysiert und bekannt sind und die Person eine stabile Erkrankung oder sogar ein vollständiges Ansprechen auf die Therapie zeigt, aber das Risiko eines Rückfalls besteht. Mit Liquid Biopsys kann das mögliche Auftreten einer Resterkrankung oder von Rezidiven so früh wie möglich erkannt werden. Zu diesem Zweck ist unser Produkt Liquid Biopsy Focus gut geeignet. Die Analyse konzentriert sich auf eine relativ kleine Anzahl ausgewählter Gene. Nichtsdestotrotz ist eine hohe Sensitivität erforderlich. Daher verwenden wir Duplex-UMIs in Kombination mit einer hohen Sequenziertiefe. Dadurch können wir Varianten mit einer Allelfrequenz von bis zu 0,25 % nachweisen.

Dies waren nur zwei mögliche Anwendungsbeispiele. Wir wissen jedoch, dass jedes Projekt und seine Anforderungen unterschiedlich sind. Deshalb bieten wir verschiedene Dienstleistungen für die Analyse von Liquid Biopsys an und beraten Sie gerne bei der Suche nach der optimalen Strategie für Ihr Projekt. Wir sind Ihr kompetenter Partner bei der Überführung von Liquid-Biopsy-Assays in die klinische Praxis.

Video: Nutzen Sie die vielfältigen Möglichkeiten von Liquid Biopsy (EN)

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