CeGaT setzt neue Maßstäbe in der Ataxie-Diagnostik und bietet nun eine Analyse von FGF14-Repeat-Expansionen an, die entscheidend ist für die Diagnose von spinozerebellärer Ataxie vom Typ 27B (SCA27B). Herkömmliche Sequenziermethoden können pathogene FGF14-Expansionen nicht detektieren und daher bleiben viele Fälle unentdeckt. Weltweit gibt es neben CeGaT nur drei weitere Anbieter, die diese diagnostische Lücke schließen.
Herausforderungen bei der SCA27B-Diagnostik überwinden
SCA27B ist eine seltene, spät einsetzende neurodegenerative Erkrankung, die vor allem die Gangkoordination beeinträchtigt und langsam fortschreitet. Die Symptome können episodisch auftreten und durch Alkohol oder körperliche Anstrengung ausgelöst werden. Die Ursache liegt in einer abnormalen Expansion einer sich wiederholenden DNA-Sequenz (Repeat). Bei SCA27B wiederholt sich die GAA-Sequenz (Guanin, Adenin, Adenin) übermäßig und überschreitet eine pathogene Schwelle.
Pathogene Expansionen in FGF14 zu identifizieren ist besonders anspruchsvoll, da sowohl die Länge als auch die Reinheit der Repeats über die Pathogenität entscheiden. Bei SCA27B gilt eine Expansion von mehr als 300 GAA-Repeats als eindeutig pathogen. Expansionen zwischen 250 und 300 Wiederholungen werden als wahrscheinlich pathogen eingestuft, haben jedoch eine geringe Penetranz. Wenn die GAA-Sequenz durch andere Basen unterbrochen wird (nicht-reine Expansionen), sind sie in der Regel nicht pathogen – ganz unabhängig von ihrer Länge.
Da herkömmliche Short-Read-Sequenziermethoden diese pathogenen Expansionen nicht nachweisen können, bleiben viele Fälle unerkannt oder werden erst zu spät diagnostiziert. Um diese kritische Lücke zu schließen, hat CeGaT einen spezialisierten Test entwickelt, der FGF14-Repeat-Expansionen zuverlässig identifiziert und eine präzise Diagnosestellung sicherstellt.
CeGaTs Ansatz
Unser hochentwickeltes Testverfahren kombiniert Long-Range-PCR , Kapillarelektrophorese und Agarose-Gelelektrophorese zur exakten Größenbestimmung der Expansionen. Eine anschließende auf Repeats ausgelegte PCR (repeat-primed PCR) bestätigt die Verdachtsdiagnose SCA27B. Mit diesem Ansatz erhalten Ärztinnen und Ärzte eine verlässliche Grundlage für die Diagnose und Therapieentscheidungen.
Die FGF14-Repeat-Expansion-Analyse ergänzt CeGaTs umfassendes Diagnostik-Portfolio für neurodegenerative Erkrankungen. Basierend auf unserer ExomeXtra®-Anreicherung und mit flexiblen Panel-Optionen – darunter Tests für weitere Repeat-Erkrankungen – bietet CeGaTs Panel für neurodegenerative Erkrankungen einen schrittweisen Ansatz für eine präzise genetische Diagnostik.
Kontaktieren Sie unseren Diagnostic Support unter +49 (0) 7071 565 44 55 oder schreiben Sie an diagnostic-support@cegat.com, um die beste Strategie für Ihre Patientinnen und Patienten zu besprechen.