Array-CGH

Als Array-CGH-Analyse wird eine molekulargenetische Methode bezeichnet, mit deren Hilfe kleine Gewinne oder Verluste in chromosomalem Material nachgewiesen werden können, die unterhalb der Detektionsgrenze einer konventionellen Chromosomenanalyse liegen. Bei der Array-CGH (Array-based Comparative Genomic Hybridization) werden die Patienten-DNA und eine Referenz-DNA mit unterschiedlichen Fluoreszenz-Farbstoffen markiert und auf einem Trägerchip mit immobilisierten DNA-Fragmenten („Probes“ oder Sonden) cohybridisiert. Diese Sonden decken das menschliche Genom möglichst gleichmäßig ab. Numerische Veränderungen führen zu einer Farbverschiebung des Fluoreszenzsignals für die einzelnen Sonden. Diese Signale werden mittels eines Laserscanners erfasst und mit einer entsprechenden Software der jeweiligen chromosomalen Region zugeordnet und dargestellt („molekulares Karyotyping“).

Bei CeGaT können alle erhältlichen Arrayformate der Firma Agilent prozessiert, analysiert und befundet werden. In der Routine verwenden wir den Agilent 180K Array mit einer diagnostischen Auflösung von ≥ 50kb.

Nach Rücksprache besteht außerdem die Möglichkeit, individuelle hochauflösendere Arrays zu analysieren.

Durch die Detektion von Mikrodeletionen und Mikroduplikationen im Genom einer Patientin oder eines Patienten können mithilfe der Array-CGH-Analyse deutlich kleinere Abweichungen, als bei der konventionellen Chromosomenanalyse erkannt werden. Eine herkömmliche Chromosomenanalyse ermittelt nur bei etwa 3 %–4 % der untersuchten Patientinnen und Patienten mit Entwicklungsverzögerungen eine strukturelle genomische Veränderung. Durch die genomweite Analyse können mithilfe der Array-CGH-Analyse bei bis zu 15 % der Patientinnen und Patienten ursächliche Veränderungen detektiert werden. Die Array-CGH-Analyse kann unklare Fälle mentaler Retardierung oder seltene syndromale Krankheitsbilder auflösen. Außerdem können Verluste oder Zugewinne, die bei einer Chromosomenanalyse ermittelt wurden, präziser charakterisiert werden.